Blue Air a introdus sistemul gratuit de check-in online și pentru zborurile din Barcelona, Nisa, Larnaca, Malaga și Valencia.
În scurt timp urmează ca acest sistem să fie disponibil pentru majoritatea destinațiilor Blue Air. Serviciul poate fi utilizat de pasageri cu maxim 14 zile înainte de data plecării și cu până la 3 ore înaintea decolării. Cei care au doar bagaj de mână se pot prezenta la poarta de îmbarcare cu 60 de minute înainte de decolare, cei cu bagaj de cală trebuind să sosească la poartă cu 90 de minute înainte de zbor. Totodată, din 3 octombrie 2011 Blue Air introduce o taxă de check-in la aeroport de 5 sau 10 euro, valabilă pentru plecările din Barcelona, Nisa, Larnaca, Malaga și Valencia. Pasagerii care și-au cumpărat bilete pe rutele Larnaca-București, Larnaca-Bacău, Nisa-București, Malaga-București, Valencia-București, Barcelona-București și Barcelona-Bacău înainte de 19 septembrie 2011 nu vor plăti taxa de check-in în aeroport.